Un modelo interno de Claude generó diseños de proteínas que permitieron identificar 17 capaces de unirse a neurotoxinas de escorpión en pruebas de laboratorio. El proyecto de Anthropic y sus colaboradores combinó una campaña computacional de 64 horas con ensayos posteriores realizados por Adaptyv Bio y Twist Bioscience.
Los laboratorios evaluaron 211 diseños y 17 cumplieron los criterios de unión establecidos por el equipo. Los resultados abarcaron cuatro de las cinco toxinas estudiadas. La investigación midió la capacidad de las proteínas para adherirse a sus objetivos, una etapa inicial en el desarrollo de posibles tratamientos.
Anthropic trabajó con Citrini Research, una firma de investigación de inversiones que propuso explorar si personas sin una trayectoria especializada en desarrollo de fármacos podían abordar un problema de salud con Inteligencia Artificial. El modelo recibió una instrucción inicial y cuatro indicaciones posteriores para orientar el trabajo.
Claude generó más de 318.000 diseños durante la campaña
El sistema utilizó 12 herramientas de diseño y produjo 318.484 candidatos. También examinó mediante predicciones computacionales 553.052 pares de proteína y toxina para estimar cómo encajarían. Estas evaluaciones redujeron el conjunto a 180 diseños seleccionados para pruebas; los investigadores añadieron otros 31 con asistencia del modelo.
Las 64 horas correspondieron a la campaña de diseño, que consumió aproximadamente 10.000 horas de procesamiento gráfico acumuladas. Esa cifra suma el trabajo de los equipos utilizados y no equivale a la duración transcurrida del experimento completo. La fabricación de proteínas y su comprobación física constituyeron etapas posteriores.
Los objetivos incluyeron toxinas asociadas con escorpiones de México, Brasil, el norte de África y Medio Oriente. Siete proteínas cumplieron los criterios frente a Cn2, cuatro frente a AaH II, cuatro frente a AaH I y dos frente a LqhIII. Ninguna alcanzó el umbral requerido frente a Ts1, la toxina brasileña incluida en el estudio.
El equipo también buscó proteínas que se unieran a varias toxinas. Sin embargo, ninguno de los 151 diseños destinados a dos o más objetivos cumplió los criterios para más de uno. Entre los 60 diseños orientados a una sola toxina, 11 lograron la unión exigida, una tasa cercana al 18%.
Las pruebas de unión preceden a la evaluación de un posible antiveneno
Adaptyv Bio y Twist Bioscience fabricaron las proteínas en formatos diferentes y midieron cómo se unían y separaban de las toxinas. Para clasificar los resultados, el equipo exigió señales repetidas de unión y descartó interacciones con una proteína humana ajena al objetivo. LqhIII fue evaluada únicamente por Adaptyv Bio.
Dos candidatos frente a Cn2 mostraron una unión especialmente estrecha y compitieron por una zona similar a la que ocupa un fragmento de anticuerpo previamente estudiado. Ese hallazgo sirve como indicio para investigar su posible función protectora. El trabajo amplía las aplicaciones experimentales de Claude en investigación biológica.
Los ensayos utilizaron toxinas producidas en laboratorio. La neutralización en células y la eficacia en animales siguen pendientes. “No afirmamos haber producido un antiveneno”, señaló Anthropic en la presentación de los resultados. El siguiente paso propuesto incluye comprobar la unión a toxinas extraídas del veneno y estudiar si los candidatos bloquean su acción sobre las células nerviosas.
Los 211 diseños y sus datos experimentales quedaron disponibles para otros investigadores. Proteinbase, la plataforma de Adaptyv Bio, reúne 679 mediciones de pares de diseño y toxina. Su catálogo distingue las señales de unión de ese laboratorio del criterio más exigente que Anthropic utilizó para seleccionar las 17 proteínas finales.
